Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms