Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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