Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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