Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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PTPRRQ15256 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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PTPRRQ15256 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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