Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
GAPVD1Q14C86 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GAPVD1Q14C86 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
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