Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms