Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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RFTN1Q14699 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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RFTN1Q14699 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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RFTN1Q14699 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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