Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Length 614 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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NCOA4Q13772 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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NCOA4Q13772 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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