Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA7Q13683 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms