Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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