Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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SP140Q13342 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SP140Q13342 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SP140Q13342 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SP140Q13342 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SP140Q13342 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SP140Q13342 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SP140Q13342 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SP140Q13342 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SP140Q13342 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SP140Q13342 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SP140Q13342 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP140Q13342 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SP140Q13342 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SP140Q13342 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP140Q13342 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP140Q13342 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SP140Q13342 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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SP140Q13342 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP140Q13342 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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SP140Q13342 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP140Q13342 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP140Q13342 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP140Q13342 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SP140Q13342 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP140Q13342 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP140Q13342 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP140Q13342 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SP140Q13342 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP140Q13342 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP140Q13342 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP140Q13342 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP140Q13342 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SP140Q13342 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP140Q13342 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP140Q13342 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SP140Q13342 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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