Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms