Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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