Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms