Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms