Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms