Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms