Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms