Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZBED6P86452 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms