Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HBBP68871 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms