Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms