Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLDN8P56748 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLDN8P56748 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLDN8P56748 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLDN8P56748 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN8P56748 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN8P56748 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN8P56748 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN8P56748 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN8P56748 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN8P56748 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN8P56748 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN8P56748 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms