Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SMARCA2P51531 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms