Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms