Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A3P48751 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms