Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms