Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR4P46093 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR4P46093 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR4P46093 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR4P46093 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR4P46093 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR4P46093 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR4P46093 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR4P46093 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR4P46093 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR4P46093 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR4P46093 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR4P46093 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR4P46093 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR4P46093 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR4P46093 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR4P46093 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR4P46093 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR4P46093 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR4P46093 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms