Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms