Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms