Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms