Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRP12270 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPRP12270 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms