Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLA1P09884 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
POLA1P09884 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
POLA1P09884 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLA1P09884 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLA1P09884 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLA1P09884 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLA1P09884 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLA1P09884 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLA1P09884 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLA1P09884 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLA1P09884 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLA1P09884 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLA1P09884 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLA1P09884 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLA1P09884 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLA1P09884 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
POLA1P09884 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLA1P09884 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
POLA1P09884 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLA1P09884 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLA1P09884 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
POLA1P09884 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLA1P09884 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLA1P09884 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLA1P09884 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLA1P09884 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLA1P09884 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLA1P09884 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLA1P09884 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLA1P09884 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLA1P09884 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLA1P09884 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLA1P09884 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLA1P09884 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLA1P09884 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLA1P09884 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLA1P09884 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLA1P09884 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLA1P09884 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLA1P09884 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
POLA1P09884 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLA1P09884 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLA1P09884 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLA1P09884 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLA1P09884 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLA1P09884 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
POLA1P09884 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLA1P09884 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLA1P09884 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLA1P09884 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLA1P09884 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLA1P09884 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLA1P09884 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLA1P09884 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
POLA1P09884 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLA1P09884 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLA1P09884 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLA1P09884 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms