Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFLP07196 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFLP07196 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFLP07196 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFLP07196 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFLP07196 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFLP07196 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFLP07196 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFLP07196 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFLP07196 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFLP07196 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFLP07196 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFLP07196 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFLP07196 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFLP07196 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFLP07196 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFLP07196 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFLP07196 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFLP07196 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFLP07196 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFLP07196 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFLP07196 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFLP07196 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFLP07196 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFLP07196 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFLP07196 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFLP07196 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFLP07196 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFLP07196 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFLP07196 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEFLP07196 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEFLP07196 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEFLP07196 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEFLP07196 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEFLP07196 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEFLP07196 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEFLP07196 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms