Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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CLDN9O95484 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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CLDN9O95484 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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CLDN9O95484 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CLDN9O95484 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CLDN9O95484 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CLDN9O95484 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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CLDN9O95484 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CLDN9O95484 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CLDN9O95484 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CLDN9O95484 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CLDN9O95484 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CLDN9O95484 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN9O95484 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms