Protein–RNA interactions for Protein: O94953

KDM4B, Lysine-specific demethylase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,096 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4BO94953 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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KDM4BO94953 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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KDM4BO94953 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDM4BO94953 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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