Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms