Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COCHO43405 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COCHO43405 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
COCHO43405 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
COCHO43405 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.1 ms