Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms