Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms