Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP8AP2Q9UKL3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms