Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms