Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms