Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms