Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms