Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms