Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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SGF29Q96ES7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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SGF29Q96ES7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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SGF29Q96ES7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SGF29Q96ES7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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