Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms