Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX13Q92968 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX13Q92968 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX13Q92968 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX13Q92968 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX13Q92968 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX13Q92968 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX13Q92968 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms