Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms