Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms